התמחויות לימודי מנהל עסקים במרכז האקדמי רופין הנן, התמחות בניהול השיווק הכוללת הכרת אסטרטגיות שיווקיות ופרסומיות, היבטים הקשורים לשוק תחרותי, מודרני וגלובלי, מחקר שווקים ופיתוח. תכנית הלימודים מקנה מיומנויות וידע רבים וכן מדגישה את הנושאים העדכניים ביותר בניהול השיווק. התמחות נוספת בלימודי מנהל עסקים של המרכז האקדמי רופין היא בניהול משאבי אנוש ופיתוח ארגוני, כשתכנית הלימודים מתמקדת בפיתוח צוותים מקצועיים ומוכשרים וניהול מקצועי לצורך השגת מטרות,תכנית לימודים זו מקנה מיומנויות פרקטיות בניהול צוותים, אנשים והובלת שינויים.
התמחות נוספת של לימודי מנהל עסקים של המרכז האקדמי רופין הנה התמחות במערכות מידע, כשתכנית הלימודים מתמקדת בהכרת היבטי מחשוב טכנולוגיים, יישומיים וניהוליים ויחסם לעולם המסחר והאינטרנט. התמחות נוספת היא לוגיסטיקה ומערכות ימיות המעניקה כלי ניהול, ידע רב, כישורים ומיומנויות בניהול סחר בינלאומי מההיבטים הימיים, אוויריים ויבשתיים. תכנית לימודים נוספת היא מנהל עסקים ללא התמחות, כשהסטודנטים יכולים לבחור לעצמן את הקורסים המעניינים אותם נוסף על קורסי החובה במנהל עסקים.